质粒是一类寄宿于细胞内，独立于染色体外的自我复制并稳定遗传的环状双链DNA分子。

质粒在遗传工程中占有重要的位置，它被认为是复制子，能够在合适的宿主内自主复制的DNA单位，被广泛用作分子克隆的载体，驱动宿主体内重组DNA序列的复制，在实验室中，质粒可以通过转化进入细胞。

质粒DNA分子具有三种构型：

SC构型: 共价闭合环形DNA(cccDNA)， 超螺旋的 SC构型；

OC构型: 开环DNA(ocDNA)，OC构型；

L构型: 发生双链断裂而形成线性分子 (LDNA)，L构型。

质粒的基本特性

1、质粒的复制

通常一个质粒含有一个与相应的顺式作用控制要素结合在一起的复制起始区（整个遗传单位定义为复制子）。在不同的质粒中，复制起始区的组成方式是不同的，有的可决定复制的方式，如滚环复制和 θ 复制。在大肠杆菌中使用的大多数载体都带有一个来源于 pMB1 质粒或 ColE1 质粒的复制起始位点。

2、质粒的拷贝数

质粒拷贝数分为严谨型与松弛型。严谨型质粒每个细胞中拷贝数有限，大约1 ～几个；松弛型质粒拷贝数较多，可达几百。

3、质粒的不相容性

两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性，它是指在第二个质粒导入后，在不涉及 DNA 限制系统时出现的现象。不相容的质粒一般都利用同一复制系统，从而导致不能共存于同一宿主中。两个不相容性质粒在同一个细胞中复制时，在分配到子细胞的过程中会竞争，随机挑选，微小的差异最终被放大，从而导致在子细胞中只含有其中一种质粒。

4、转移性

质粒具转移性。它是指在自然条件下，很多质粒可以通过称为细菌接合的作用转移到新宿主内，该过程需要移动基因 mob ，转移基因 tra ，顺式因子 bom 及其内部的转移缺口位点 nic。

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